本发明公开了一种无人机飞行校验系统及校验方法。该系统的无人机动力系统和机载校验系统有线连接,无人机动力系统与地面控制系统无线连接;机载校验系统通过测试天线接收地面导航设备信号并通过信号处理模块处理所述地面导航设备信号,得到机载校验数据,并将机载校验数据有线传输至无人机动力系统;无人机动力系统将机载校验数据无线发送至地面控制系统;地面控制系统对机载校验数据进行监控,并将校验科目切换指令无线发送至无人机动力系统;无人机动力系统还用于将校验科目切换指令传输至机载校验系统;机载校验系统根据校验科目切换指令切换测试